Transport Rutier:
BotoÅŸani este situat la intersecÅ£ia drumurilor naÅ£ionale 29B (Târgu Frumos-Dorohoi) ÅŸi 29 (Suceava-Săveni), implicit pe traseul drumului european E58, ce leagă graniÅ£a de nord-vest a ţării, Halmeu, cu cea de est, nord-est, Sculeni. Astfel, oraÅŸul a fost din cele mai vechi timpuri o punte de legătură între România ÅŸi zona Bucovinei ÅŸi a Basarabiei de nord, ÅŸi, de asemenea, cu Ucraina, Polonia ÅŸi Rusia. Din punct de vedere turistic, de aici se poate ajunge cu uÅŸurinţă la mănăstirile din zona Bucovinei (VoroneÅ£, MoldoviÅ£a, SuceviÅ£a, Putna), cât ÅŸi la cele din judeÅ£, cum ar fi Vorona sau cele nemÅ£ene ÅŸi ieÅŸene. De asemenea, se poate ajunge uÅŸor la Lacul de acumulare Stânca-CosteÅŸti, cel mai mare lac de acumulare din Å£ară, situat pe Prut, la graniÅ£a cu Republica Moldova. Autostrada A4, care va face legătura dintre IaÅŸi ÅŸi Târgu MureÅŸ, se va situa la 70 km distanţă. Legătura de la BotoÅŸani la traseul tronsonului IaÅŸi-Târgu Frumos-Târgu NeamÅ£ se va face pe E58.
În municipiu există mai multe autogări din acestea se asigură curse zilnice către alte oraÅŸe din Å£ară ( ex.:BraÅŸov, BucureÅŸti, Cluj-Napoca, ConstanÅ£a, IaÅŸi, TimiÅŸoara, etc.) ÅŸi către majoritatea localităţilor din judeÅ£. Principalele probleme ale transportului rutier intrajudeÅ£ean o constituie existenÅ£a piraÅ£ilor auto ÅŸi starea proastă a reÅ£elei de drumuri.
Transport Aerien:
Cel mai apropiat aeroport este cel din Aeroportul Suceava-Salcea, aflat la 33 de kilometri. Acesta are curse regulate cu Aeroportul InternaÅ£ional Otopeni - BucureÅŸti si cu Viena. În apropiere mai sunt Aeroportul InternaÅ£ional IaÅŸi - care are curse regulate cu Viena, Budapesta, BucureÅŸti ÅŸi TimiÅŸoara, ÅŸi Aeroportul Bacău - care are curse regulate cu oraÅŸe din Italia ÅŸi Spania, îndeosebi Roma.
Transport Feroviar:
Linia de cale ferată VereÅŸti-BotoÅŸani (44 km) a fost dată în exploatare în anul 1871. Prin această linie, municipiulul BotoÅŸani este conectat la una dintre cele mai importante magistrale feroviare ale ţării, cea care asigură legătura între BucureÅŸti-Suceava-VicÅŸani. În oraÅŸ există o singură gară. Pentru a fi viabilă din punct de vedere tehnic ÅŸi economic, la nivelul cerinÅ£elor secolului XXI, calea ferată VereÅŸti-BotoÅŸani trebuie reconsolidată pentru o viteză comercială superioară, trebuie centralizată electrodinamic, electrificată ÅŸi dublată cel puÅ£in pe porÅ£iunea Leorda-BotoÅŸani (15 km). De-a lungul timpului au fost întreprinse mai multe demersuri pentru realizarea unei conexiuni feroviare directe între oraÅŸele BotoÅŸani ÅŸi IaÅŸi, astfel încât, în zona BotoÅŸani, transportul feroviar să devină eficient din punct de vedere economic. Un proiect care avea în vedere o cale ferată IaÅŸi-Hârlău-BotoÅŸani a fost materializat iniÅ£ial doar pe jumătate, între IaÅŸi ÅŸi Hârlău, iar apoi, în anii 80-90, între Hârlău ÅŸi Flămânzi, porÅ£iune care însă nu a fost finalizată, lucrările executate fiind azi în curs de degradare. Un alt proiect care prevedea o legătura feroviară între BotoÅŸani ÅŸi staÅ£ia Todireni de pe linia IaÅŸi-Dorohoi a rămas doar în stadiul de lege aprobată de Parlament în perioada interbelică. Pe lângă faptul că ar revitaliza din punct de vedere economic zona văii Jijiei, varianta de traseu BotoÅŸani-Todireni (aproximativ 50 km, de-a lungul văii râului Sitna) ar putea fi, de asemenea, parte a preconizatei legături feroviare dintre BotoÅŸani ÅŸi oraÅŸul BălÅ£i din Republica Moldova.
